医疗研究员用VR开发可视化单细胞数据的工具
可视化单细胞数据的工具
（映维网Nweon 2024年08月05日）现代医疗研究产生了大量的数据，向科学家们提出了可视化和分析数据的挑战。针对这个问题，德国的研究人员把目光投向了虚拟现实，并开发了一种能够可视化单细胞数据的工具。
抗生素耐药性正在上升，并对卫生保健系统构成重大挑战。了解细菌如何以及为何产生这种防御的潜在过程至关重要。
其中，细菌基因表达的差异，亦即解读基因信息的方式，可以提供关键的线索。
scRNA-seq已经成为分析相关差异的重要工具。这项技术提供了在特定时间点单个细胞中基因表达的详细图像。然而，这种方法产生了大量的数据，研究人员很难将其可视化和分析。
所以，非常需要全新的方法和工具来显示和理解相关信息。
针对这个问题，德国的研究人员基于虚拟现实开发了名为sCIRCLE的工具。它可以实现scRNA-seq数据的交互式3D可视化，并允许用户从不同的角度实时查看包含丰富元数据的单个细胞。
研究人员可以使用各种过滤器和设置来探索哪些基因在特定时间点在特定细胞中表达，从而能够专注于特定的细胞群或感兴趣的基因。
研究人员指出：“随着我们的数据集不断增长，生物信息学和设计学科之间的合作非常重要，我们需要新的方法来提高它们的易理解性。”
尽管这个应用程序目前只提供基本的虚拟现实集成，但团队计划在未来为数据探索创建更多易于使用的虚拟空间。
